电影《法医密码》讲述了东江市公安局的法医米小米在处理一起无名女尸案时，意外卷入了一场充满谜团的犯罪事件，与刑警温梓锋携手合作，逐渐解开了一个个令人疑惑的谜题。

故事的开端是一名无名女尸的发现，但这起案件的复杂性在于与法医米小米的姐姐米小佳的自杀案存在莫大关联。米小米在处理案件过程中，心怀芥蒂，但与之搭档的温梓锋却并不了解她的内心情感。在案件调查中，两人不断碰撞，但也因此逐渐接近真相。

随着调查的深入，案件出现了重大突破，确认了女尸的身份，她是一名做过整容手术的网红主播曹越。进一步的调查将嫌疑人锁定在了富二代李阳身上，但缺乏直接证据。然而，米小米的法医检测却在李阳的棒球棍上发现了血液反应，为案件提供了关键的线索。

尽管李阳已经承认了自己的罪行，但温梓锋始终怀疑案件背后还隐藏着更多的真相。他发现曹越案与三年前一起整容女尸案有着惊人的相似之处，这使他产生了疑虑，认为案件的真相并没有完全揭示出来。

电影《法医密码》通过扣人心弦的情节，展现了米小米、温梓锋以及其他相关人物在复杂案件中的角色和情感纠葛。这部影片带领观众一同走进一个充满悬疑和挑战的犯罪解谜之旅，揭示了人性的复杂性和真相的不断变化。